Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 RPL12P38-202ENST00000588627 2319 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC01197-205ENST00000614853 1774 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 TPD52-202ENST00000379097 2563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC145207.5-201ENST00000582866 2682 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 PARP2-204ENST00000527915 1980 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 TTC21A-205ENST00000440121 3941 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 NR3C2-207ENST00000511528 2967 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 PDLIM5-221ENST00000542407 2979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AIFM1-205ENST00000460436 1925 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AF121897.1-201ENST00000411867 3980 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 SERPIND1-201ENST00000215727 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC011753.4-201ENST00000417974 311 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 OR10G8-201ENST00000431524 1045 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL512882.1-201ENST00000436086 832 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC00350-201ENST00000438640 422 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 GPR141-202ENST00000447769 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC090835.1-201ENST00000515189 1024 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AP003555.2-201ENST00000528507 655 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 TMEM106C-219ENST00000552546 742 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 SUPT16H-204ENST00000555943 915 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 RN7SL311P-201ENST00000579858 306 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MIR4642-201ENST00000583943 82 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC093503.1-202ENST00000598743 478 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LINC01515-209ENST00000599409 755 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL583859.2-202ENST00000602311 505 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AL021807.1-201ENST00000607175 565 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 GPX5-201ENST00000412168 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 GTF2H1-210ENST00000530496 1700 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 OR2T11-202ENST00000641193 3770 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ARID4AP29374 MCPH1-201ENST00000344683 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 CCT6P2-201ENST00000507234 1593 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PLXDC2-203ENST00000377252 12468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC004947.1-201ENST00000420912 2781 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC138409.1-201ENST00000505001 3598 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 MARK2P10-201ENST00000454959 1437 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 OPTN-203ENST00000378748 3521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 ODF2-220ENST00000604420 3030 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 RNA5SP427-201ENST00000365323 119 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PHF6-203ENST00000370800 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 RPL23A-203ENST00000394938 688 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
ARID4AP29374 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms