Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NCOA3Q9Y6Q9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NCOA3Q9Y6Q9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NCOA3Q9Y6Q9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms