Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KLF12Q9Y4X4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms