Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP3Q9Y446 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP3Q9Y446 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms