Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms