Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNIP3Q9Y2W7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms