Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms