Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GNEQ9Y223 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GNEQ9Y223 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms