Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KIAA1024Q9UPX6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIAA1024Q9UPX6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms