Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGTPBP1Q9UPW5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms