Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TRAK1Q9UPV9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms