Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TTF2Q9UNY4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTF2Q9UNY4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms