Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNRGQ9UMZ2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYNRGQ9UMZ2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms