Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms