Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
INO80Q9ULG1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
INO80Q9ULG1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms