Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRAPPC2LQ9UL33 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRAPPC2LQ9UL33 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms