Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC9Q9UKV0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC9Q9UKV0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms