Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHIC2Q9UKJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHIC2Q9UKJ5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms