Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

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Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RCAN3Q9UKA8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCAN3Q9UKA8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
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