Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCNL1Q9UK58 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCNL1Q9UK58 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms