Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SALL4Q9UJQ4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SALL4Q9UJQ4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms