Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPUSD1Q9UJJ7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms