Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIPSNAP3AQ9UFN0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms