Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CTNNAL1Q9UBT7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms