Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL20A1Q9P218 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL20A1Q9P218 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms