Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GGA3Q9NZ52 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GGA3Q9NZ52 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms