Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FAM53CQ9NYF3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FAM53CQ9NYF3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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