Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDX43Q9NXZ2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DDX43Q9NXZ2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms