Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD3Q9NX63 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD3Q9NX63 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms