Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KCNIP2Q9NS61 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms