Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAPOLBQ9NRJ5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms