Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SH2B1Q9NRF2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SH2B1Q9NRF2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms