Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms