Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB9BQ9NP90 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms