Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NRDE2Q9H7Z3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NRDE2Q9H7Z3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms