Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PARLQ9H300 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms