Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMX4Q9H1E5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMX4Q9H1E5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms