Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD1Q9GZZ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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HOXD1Q9GZZ0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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HOXD1Q9GZZ0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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HOXD1Q9GZZ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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HOXD1Q9GZZ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD1Q9GZZ0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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