Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZC3H12CQ9C0D7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZC3H12CQ9C0D7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms