Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM5Q9C035 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM5Q9C035 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms