Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ROPN1BQ9BZX4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ROPN1BQ9BZX4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms