Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms