Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UPF3BQ9BZI7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UPF3BQ9BZI7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms