Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms