Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC4A5Q9BY07 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC4A5Q9BY07 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms