Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRIP1Q9BX63 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRIP1Q9BX63 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms