Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PI4K2AQ9BTU6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PI4K2AQ9BTU6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms