Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SYT11Q9BT88 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SYT11Q9BT88 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms