Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RTKNQ9BST9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms