Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PMCHL2Q9BQD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PMCHL2Q9BQD1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms